传说盘古死后，元神化为三清尊神，三清是道教的最高神，因为昆仑山是天下风水最好的宝地，所以三清之一的元始天尊将盘古的洪荒神力安放在昆仑山上，并且成立了阐教，就是为了守护这股力量，不被邪魔侵害，否则三界动荡。
除了元始天尊，还有女娲，伏羲，王母娘娘和陆压等大神都住在昆仑山中。女娲补天的五色石采自昆仑山，而王母娘娘在昆仑山上修炼成混元大罗金仙。
神仙们住的地方，人类自然不能接近，那里有一个非常著名的人类禁地——昆仑山死亡谷。小说《鬼吹灯之黄皮子坟》中，阎王殿百眼窟的出处就是死亡谷，这里人迹罕至，很多进入谷地的人都有去无回，被人们称为“地狱之门”。
1979年，我国曾派出一支部队驻守昆仑山，保护一支前去死亡谷考察的科学考察团，传言这个科考团曾在死亡谷发现一个类人形的巨大遗骸，没有人知道那是什么。到了1983年，一位牧民赶着马匹进入死亡谷，离奇死亡，当时有地质队成员不断寻找，经过几日才找到尸体，而身上没有任何伤口，猎枪完好无损，食物也充足，没有人知道他是怎么死的。
目前，随着科学水平和人类认知的发展，昆仑山的神秘感已大不如前，但是它仍然有很奇特无法用科学解释的现象，死亡谷仍然人迹罕至。
